Skip to content

Podpisy autoprzeciwciał w raku prostaty ad

4 tygodnie ago

471 words

Miał etap odkrywania, szkolenia i walidacji. Wszystkie próbki surowicy, o ile nie wskazano inaczej, uzyskano od pacjentów z University of Michigan Health System. Pisemną świadomą zgodę uzyskano od wszystkich pacjentów. Bank tkanek i serum w specjalistycznym programie badawczym University of Michigan w zakresie raka prostaty zebrał ponad 2000 próbek surowicy od 1995 roku. Spośród nich 331 próbek pobranych od 1995 do 2004 roku spełniało następujące kryteria: zostały one uzyskane natychmiast przed operacją od pacjentów z potwierdzonym biopsją, klinicznie zlokalizowanym rakiem prostaty, którzy mieli co najmniej 40 lat i którzy nie otrzymali wcześniejszej terapii raka prostaty. Spośród 331 próbek, 150 losowo wybrano do fazy odkrywania, treningu i walidacji badania. Cztery próbki zostały wykluczone, ponieważ białka wytrąciły się w fiolkach surowicy. Dwanaście próbek spełniających kryteria zostało uzyskanych od Dana – Farber Cancer Institute w fazie walidacji w celu zbadania solidności testu w różnych instytucjach. Próbki te zostały losowo wybrane spośród 236 próbek spełniających kryteria kwalifikowalności.
Laboratoria Patologii Klinicznej Uniwersytetu Michigan dostarczyły 159 próbek kontrolnych surowicy od mężczyzn w wieku od 46 do 83 lat, którzy nie mieli historii raka. Próbki te zostały zebrane w latach 2001-2004 w trzech niezależnych okresach zbierania. Dodatkowe 55 próbek (oznaczonych jako inne ) zebrano od pacjentów po prostatektomii (14 próbek) lub od mężczyzn z zaawansowanym opornym na hormony rakiem gruczołu krokowego (11) lub z rakiem płuc (30, losowo wybranych z 74 próbek uzyskanych z pacjenci płci męskiej). Szczegóły dotyczące próbek surowicy, które zostały użyte w naszej innej kohorcie, znajdują się w Dodatkowym Dodatku (dostępnym wraz z pełnym tekstem tego artykułu na stronie www.nejm.org).
W fazie odkrywania (biopanning i mikromacierze 2304 elementowe) wykorzystano 39 próbek raka gruczołu krokowego i 21 próbek kontrolnych. Etap szkoleniowy obejmował wykorzystanie 59 próbek raka prostaty i 70 próbek kontrolnych. Aby ocenić detektory fagów i peptydów, które opracowaliśmy w fazach odkrywania i treningu, wykorzystaliśmy niezależny zestaw walidacyjny 60 próbek raka gruczołu krokowego (48 z University of Michigan i 12 z Dana – Farber Cancer Institute) i 68 próbek kontrolnych . Ponadto 55 próbek w kategorii inne oceniono wyłącznie w fazie walidacji.
Tabela 1. Tabela 1. Dane kliniczne i patologiczne dla próbek szkoleniowych i walidacyjnych. W 257 próbkach raka prostaty i próbkach kontrolnych (które zawierały zestawy treningowe i walidacyjne [Tabela 1]), mediana poziomów PSA wynosiła 6,3 ng na mililitr (zakres od 0,1 do 46,3) i 1,7 ng na mililitr (zakres, 0,1 do 24,5).
Profilowanie autoprzeciwciał
Rysunek 1. Rysunek 1. Schematyczne przedstawienie rozwoju mikromacierzy białek fagowych w celu scharakteryzowania podpisów autoprzeciwciał w raku prostaty (faza odkrywania). Bibliotekę cDNA skonstruowano z puli całkowitego mRNA wyizolowanego z tkanki raka prostaty uzyskanego od sześciu pacjentów. Po trawieniu bibliotekę cDNA wprowadzono do wektora faga T7
[hasła pokrewne: co to są choroby genetyczne, przychodnia eskulap, głęboka dysleksja ]
[hasła pokrewne: koszt badania fsh, poradnia endokrynologiczna dla dzieci, dentysta warszawa ursynów ]