Skip to content

Podpisy autoprzeciwciał w raku prostaty ad 6

4 tygodnie ago

188 words

4A przedstawia mapę cieplną wyników z 22 klonów fagowo-peptydowych w zbiorze treningowym. Walidacja detektora faga-peptydu
Przy użyciu detektora 22-fagowego peptydu pochodzącego z fazy treningowej, zastosowaliśmy schemat ważonego głosowania, aby sklasyfikować próbki w niezależnym zbiorze walidacyjnym (128 pacjentów) jako rak prostaty lub kontrolę (Figura 2). Łącznie 8 z 68 próbek surowicy od kontroli i 11 z 60 próbek od pacjentów z rakiem prostaty zostały błędnie zaklasyfikowane w tym zestawie walidacyjnym (Figura 4B i Tabela 12 Dodatku Aneks). Wyniki te dały swoistość 88,2% (przedział ufności 95%, 78 do 95) i czułość 81,6% (przedział ufności 95%, 70 do 90). Podobne kryteria wydajności zostały zaobserwowane przy użyciu różnych modeli predykcji klas i drugiej randomizacji zbioru danych (sekcja II dodatku uzupełniającego).
Następnie obliczyliśmy krzywe charakterystyki działania odbiornika dla detektora 22-fagowego i poziomu PSA w zbiorze walidacyjnym. Różne wartości odcięcia ważonych wyników głosowania zostały użyte jako punkty progowe do wykreślenia rzeczywistej pozytywnej stopy względem fałszywie dodatniej wartości dla modelu predykcji. Zdolność panelu 22 peptydów fagowych do rozróżnienia między próbkami raka gruczołu krokowego a próbkami kontrolnymi był znaczący (P <0,001), z obszarem pod krzywą równym 0,93 (95 procent przedziału ufności, 0,88 do 0,97) (Figura 4C) . Pole pod krzywą dla PSA wynosiło 0,80 (P <0,001, przedział ufności 95%, 0,71 do 0,88). Oczekiwano tego wyniku, ponieważ ci pacjenci zostali zidentyfikowani głównie przez podwyższony poziom PSA. Wśród pacjentów z poziomami PSA od 4 do 10 ng na mililitr w zestawie walidacyjnym, detektor fagot-peptyd miał znaczącą moc dyskryminacyjną (P <0,001) w porównaniu z PSA (P = 0,50) w rozróżnieniu próbek surowicy od pacjentów z rakiem prostaty od kontroli. Powierzchnia pod krzywą wynosiła 0,93 (przedział ufności 95%, 0,86 do 1,00) dla metody prezentacji fagowej i 0,56 (przedział ufności 95%, 0,38 do 0,74) dla PSA (Figura 4D). Gdy dolna granica PSA została zmniejszona do 2,5 ng na mililitr, siła dyskryminacyjna profilu faga-peptyd była utrzymywana (P <0,001), z obszarem pod krzywą 0,94 (95 procent przedziału ufności, 0,88 do 1,00), natomiast dla PSA spadł nieznacznie do 0,50 (przedział ufności 95%, od 0,33 do 0,66) (rysunek 4E i sekcja III dodatku uzupełniającego).
Użyliśmy także detektora 22-fagowego do testowania 55 próbek surowicy w kategorii inne . Wśród próbek pobranych od pacjentów po prostatektomii 5 z 14 próbek zostało sklasyfikowanych jako rak prostaty, a 3 z 11 próbek od pacjentów z chorobą oporną na hormony zostały sklasyfikowane jako rak prostaty (Tabela 13 Dodatku Uzupełniającego). Spośród 30 próbek od pacjentów z gruczolakorakiem płuca 9 zaklasyfikowano jako mających raka prostaty, co sugeruje pewną reaktywność krzyżową autoprzeciwciał w różnych typach nowotworów.
Charakterystyka detektora fagowego i peptydowego
Panel 22 klonów fagopeptydowych sekwencjonowano
[więcej w: pta zabieg, przychodnia mswia warszawa, neurolog dziecięcy radom ]
[więcej w: ile kosztują badania okresowe do pracy, pedodonta warszawa, apteka internetowa chrzanów ]